Mit dieser Jira können Projekte und Teams geplant und organisiert werden. Diverse Echtzeit-Bericht- und Export­funktionen veranschaulichen den Verlauf bzw. Status eines Projekts / Anfragen. Teams erhalten Zugriff auf ein kollaboratives Projekt bzw. Aufgaben und sind stets über den Fortschritt informiert. Es können Aufgaben und eine geschätzte Erledigungszeit oder Deadlines zugewiesen werden. Dadurch kann die Arbeits­belastung eines jeden Mita­rbeiters oder Teams angezeigt werden und Projekte gegebenenfalls umorga­nisiert werden. Mit­arbeiter können über ihren Browser auf Jira Core zugreifen. Alle relevanten Infor­mationen und Anhänge können an einem Ort gespeichert und verwaltet werden. Jira Core ist für alle Abteilungen eines Unter­nehmens geeignet und kann ent­sprechend angepasst werden. So können im Marketing beispiels­weise Produkt­veröffent­lichungen geplant oder in der Personal­organi­sation Vor­stellungs­gespräche doku­mentiert und nach­verfolgt werden. Jira Core kann über die Cloud gehostet und verwendet oder auf eigenen Servern betrieben werden.

Die Applikation Jira Service Desk ist ein für IT- Teams entwickeltes Service-Manage­ment-Tool für Vorfalls-, Änderungs- und Problem­manage­ment (Incident, Change and Problem Manage­ment). Mit diesem Tool können Firmen ihren Kunden Hilfe anbieten. Erstellte Tickets können an die richtigen An­sprech­partner weiter­geleitet und überwacht werden, um in der vorge­gebenen Zeit bearbeitet zu werden und dadurch Service Level Agree­ments einzu­halten.
Die in Jira Service Desk erstellten Tickets können mit Jira Software-Vorgängen verlinkt werden. So werden alle invol­vierten Parteien über den aktu­ellsten Stand informiert. Kunden können sich selbst helfen, indem Jira Service Desk mit einer Wissens­daten­bank verknüpft wird.